1、血行感染：细菌从身体内的病灶侵入血流，到达肾脏引起肾盂肾炎的炎症，引起炎症，血行感染时，细菌首先到达肾皮质，并在该处形成多数小脓肿，然后沿肾小管向下行扩散到肾乳头和肾盂。因此，这是引起肾盂肾炎的病因之一。
2、上行感染：这是最为常见的引起肾盂肾炎的病因的因素。当机体抵抗力下降、尿道粘膜有轻微损伤后，细菌易侵袭膀胱和肾脏造成感染。由于女性尿道远较男性短而宽，女婴尿道口常被粪便污染，故易致肾盂肾炎。
3、致病菌：引起肾盂肾炎的致病菌以大肠杆菌为最多，其次为副大肠杆菌，变形杆菌，粪链球菌等。
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